Giriş
Moleküler Biyolojide gen çalışmaları dinamik biyolojik bir data, bilgilerin oluşturulması, korunması ve depolanması datanın güncellenmesi için tasarlanmış bilgisayar programlarıdır. Basit bir veritabanı gerekli bilgili setini içeren çok sayıda datadan oluşan tek bir dosyadır.
Araştırmacıların depolanan veritabanındaki bilgilerden yararlanabilmesi için iki özel formatta sunulması gerekir.
- Bilgiye kolay erişimi olması
- Biyolojik özel bir soruya yanıt olabilmesi
Erişimi kolay kullanılabilir nükleotid dizilerinin açıkça gösterebilen üç temel veritabanı bulunmaktadır. Bunlar;
- NCBI tarafından oluşturulan GenBank
- Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü tarafından oluşturulan EMBL
- Japonya tarafından oluşturulan DDBJ
Bu siteler aynı sekanslama yöntemlerini kullanır ancak bu sekansları açıklarken farklı tarzda sunar.
Protein veri dizilerini sunan temel siteler
- GenBank
- EMBL
- Swiss-Prot
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
Moleküler Biyoloji alanında ki çalışmalar için bir kaynak olarak kurulan NCBI, yerel veri tabanları ve genom veri analizleri ile insan sağlığını ve hastalıklarını etkileyen moleküler boyuta geçmişlerini daha iyi anlayıp sunabilmek için biyomedikal bilgilerin kullanılmasıyla çalışmalarına devam etmektedir.
NCBI’ ın 4 temel özelliği vardır. Bunlar;
- İlk olarak biyolojik verinin Amerika adına toplanması
- Bilimsel topluluk kuruluşları için kullanışlı analitik veritabanları oluşturmaktır.
- Elde edilen biyolojik verilerin molekül ve fonksiyonel yapılarının incelenmesini sağlamak
- Moleküler Biyoloji, Sistem Biyolojisi, Biyokimya ve Genetik gibi alanlar gibi veri oluşturma depolama
NCBI web sitesi aracılığıyla başlıca yapılabilecek araştırma seçenekleri;
- Araştırma ve Geliştirme
- Query Veritabanları ve Benzer
- Veri Sunulması
- Pubmed
- Yapı
- Veritabanları
- Taksonomi
Kaynak: https://www.researchgate.net/publication/280041396_Biyoteknoloji_ve_Biyoinformatik
Görsel Kaynak: http://molcare.org/bioinformatics
Editör: Ecem Bolat