Biyoinformatik Veritabanları Nelerdir?

Tanım

Moleküler Biyolojide gen çalışmaları dinamik biyolojik bir data, bilgilerin oluşturulması, korunması ve depolanması datanın güncellenmesi için tasarlanmış bilgisayar programlarıdır. Basit bir veritabanı gerekli bilgili setini içeren çok sayıda datadan oluşan tek bir dosyadır.

Araştırmacıların depolanan veritabanındaki bilgilerden yararlanabilmesi için iki özel formatta sunulması gerekir.

Bilgiye kolay erişimi olması
Biyolojik özel bir soruya yanıt olabilmesi

Erişimi kolay kullanılabilir nükleotid dizilerinin açıkça gösterebilen üç temel veritabanı bulunmaktadır. Bunlar;

NCBI tarafından oluşturulan GenBank
Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü tarafından oluşturulan EMBL
Japonya tarafından oluşturulan DDBJ

Bu siteler aynı sekanslama yöntemlerini kullanır ancak bu sekansları açıklarken farklı tarzda sunar.

Protein veri dizilerini sunan temel siteler

GenBank
EMBL
Swiss-Prot

National Center for Biotechnology Information (NCBI)

Moleküler Biyoloji alanında ki çalışmalar için bir kaynak olarak kurulan NCBI, yerel veri tabanları ve genom veri analizleri ile insan sağlığını ve hastalıklarını etkileyen moleküler boyuta geçmişlerini daha iyi anlayıp sunabilmek için biyomedikal bilgilerin kullanılmasıyla çalışmalarına devam etmektedir.

NCBI’ ın 4 temel özelliği vardır. Bunlar;

İlk olarak biyolojik verinin Amerika adına toplanması
Bilimsel topluluk kuruluşları için kullanışlı analitik veritabanları oluşturmaktır.
Elde edilen biyolojik verilerin molekül ve fonksiyonel yapılarının incelenmesini sağlamak
Moleküler Biyoloji, Sistem Biyolojisi, Biyokimya ve Genetik gibi alanlar gibi veri oluşturma depolama

NCBI web sitesi aracılığıyla başlıca yapılabilecek araştırma seçenekleri;