Merve TELTIK Giriş
İnsan bağırsağında varolan virüslerin çoğu bakteriyofajdır, fakat bunların orada yerleşik olarak bulunan bakterilerle etkileşimi hala yanıtı olmayan bir sorudur.
Bağırsak mikrobiotası hakkında bilgi sahibi olmayan birçok bilim insanı vardır, ve konu virüsler olduğunda daha da az şey biliyorlar. Daha fazlasını öğrenmek için bilim insanları bir yıl boyunca dokuz insanın bağırsak viromunu izlediler. Bu insanlardan birini iki yıldan fazla izlediler. Bilim insanları, birçok bakteriyofaj (üreyebilmek için bakteriyel konakçılarını yok eden) türünün var olduğunu, her bireyin viromunun zamanla kararlıhale geldiğini ve her deneğin farklı viroma sahip olduğunu buldular.
McGill Üniversitesinden mikrobiyolog Corrine Maurice “Bu çalışma bağırsakta bulunan fajlar için önemli bir veri tabanı oluşturdu. Bu, halihazırda sahip olmadığımız bir veritabanıdır. Bu yüzden gerçekten havalı hipotezleri geliştirmemize imkan sağlayacaktır. Fajların sağlığımız üzerindeki etkilerine daha derinden bakmak için gerçek bir araç sağlıyor.” diye sözlerini tamamladı.
Quadram Enstitüsü (UK) bağırsak viromu üzerinde çalışan Evelien Adriaenssens “Bu çalışma insanlar arasında mikrobiyotamızın aynı bakteriyel bileşenlerini paylaştığı fikrinin aksine yetişkin bireylerin paylaştığı çekirdek bağırsak viromu diye bir şey olmadığını savunan The Scientist dergisindeki son raporları doğruluyor. Bağırsak viromu üzerine bu tür bir temel sağlayacak sağlıklı insan viromunun neye benzediği hakkında jeografik, etnik ve yaşam şekillerindeki farklılıkları hesaba katarak oluşturulacak daha çok çalışmaya ihtiyacımız vardır. Sağlıklı olan nedir bunu öğrendikten sonra karmaşık hastalık sendromlarından başlayabiliriz ve viromdaki ne tür değişikliklerin hastalık için işaretleyici olarak kullanılabileceğini belirleyebiliriz” diyor.
Collage Cork Üniversitesi’nden mikrobiyolog Andrey Shkoporov ve çalışma arkadaşları bu temeli oluşturmak için yola çıktılar. “Farklı sağlık koşullarında viromun karşılaştırmalı çalışmalarına başlamadan önce, neden sağlıklı denekler arasında bağırsak viromunun uzun süreli kararlılığına ve bireylerarası çeşitliliğine bakmıyoruz diye düşündük” dedi.
Araştırma grubu 10 yetişkinden (4 erkek, 6 kadın) her ay dışkı örnekleri topladılar. Bir kadından 19, 20 ve 26. aylarda ek örnekler topladılar. Daha sonra dışkı materyalinden viral parçaçıklar ve hücreler ayrıldı, viral nükleik asitler dizilendi.
Shkoporov, bilimde bağırsak virüslerinin %99’u bilinmediğinden orada ne olduğunu anlamak için varolan veri tabanlarına bel bağlamanın mümkün olmadığını söyledi. Bunun yerine yazarlar dizileri örtüşen DNA sekanslarını bir araya getirdiler, protein kodlayan genleri tahmin ettiler ve daha sonra veritabanındaki proteinlerle muhtemel kodlanmış uzun DNA dizileri arasında herhangi bir benzerlik olup olmadığını belirlemeye çalıştılar. Shkoporov, bu çalışmanın ne tür virüslerle baş etmeye çalıştıkları konusunda fikir sahibi olmalarını sağladığını da ekledi.
Araştırmacılar 9 Ekim’de Cell Host and Microbiome dergisinde, bireysel viromların çalışmanın devam ettiği 12-26 ayı boyunca kararlı ve çeşitli olduğunu bildirdiler. Bunun anlamı orada birçok bakteriyofaj türü vardı. Deneklerin zaman içerisinde viral toplulukları kararlılık gösterirken, her bir bireyin tamamlayıcı bağırsak virüsleri diğerlerinden farklı görünüyordu.
Adriaenssens, The Science dergisine bireylerin çok farklı viromlara sahipken, daha yakından ilişkili bakteriyel mikrobiyomları olduğunu söyledi. Ayrıca bu durumun, farklı bireylerde sekans düzeyinde ilişkisi olmayan ayni yeri işgal eden bakteriyofajlar hakkındaki soruları gündeme getirdiğini de ekledi.
Araştırma ekibi ayrıca, bu viromlar arasında crAss benzeri fajların ve Microviridae ailesinin üyeleri dahil olmak üzere büyük oranda virülan bakteriyofaj içerdiğini tespit etti. Bu iki viral tipin de yaygın bağırsak mikroplarını enfekte ettiği tahmin edilmektedir.
Adriaenssens, “Sonraki adımlardan birisi bağırsak viromunda temel oyuncuların fonksiyonel görevlerini aydınlatmaktır. Bakteriyofaj ve onun konağını ilişkilendirebilmeye ihtiyacımız var ve bunu yapmak için, bakteri ve faj için iyi bir kültürleme sistemlerine ve onları test etmek için model sistemlere ihtiyacımız var” diyerek sözlerini sonlandırdı.
Washington Üniversitesi pediatrik gastroenteroloji uzmanı olan ve çalışmada yer almayan Lori Holts, insan bağırsak viromu ve mikrobiyomun nasıl etkileşim kurduğunun hala bilinmediğini söylüyor. Bu bulguların, gelişim veya hastalıkta mikrobiyomun görevinin daha iyi anlaşılmasını sağlayacağını ve gelecek çalışmalara önayak olduğunu vurguluyor. Ayrıca bu çalışmaların bağırsak viromunu da içermesi gerektiğini, çünkü iki sistemin nasıl etkileşim kurduğu tam olarak bilinmese de, kesinlikle bir etkileşimleri olduğu ve bunun daha fazla anlaşılması gerektiğini söylereyerek sözlerini sonlandırıyor.
Kaynak: https://www.the-scientist.com/news-opinion/human-gut-virome-is-stable-and-person-specific-66553
Görsel Kaynak: https://www.the-scientist.com/news-opinion/human-gut-virome-is-stable-and-person-specific-66553
Editör: Berfin Sucu
