Merve TELTIK Giriş
İngiltere Kolombiya Üniversitesinde uluslararası bir araştırma ekibine önderlik eden Dr. Josef Penninger, lektinler olarak bilinen proteinlerin SARS-CoV-2 virüs üzerindeki spike proteinine bağlanabildiklerini ve insan hücrelerine erişimini engelleyebildiklerini gösterdi. Video aracılığıyla da patojenin spike proteinlerinin hareketlerini yakaladılar.
Vancouver Yaşam Bilimleri Enstitüsü direktörü Dr. Penninger, “Lektinler; lipidler ve spike proteinleri gibi proteinler üzerindeki şeker molekül yapılarına bağlanabilen proteinlerdir. Amacımız bu özelliği kullanarak COVID-19 hastalığıyla savaşmak için ilaç geliştirmektir.” diye açıklıyor.
Araştırmacılar, özellikle SARS-CoV-2 spike proteinleri üzerindeki glikanlara bağlanmakta usta iki lektini bulmak için dünyadaki en büyük lektin kütüphanesini geliştirdiler.
Bu yaklaşım, güncel olarak ileri klinik araştırmalarda kullanılan ilaç adayı APN01’e dayanmaktadır. APN01, hücre yüzeyindeki ACE2 reseptörünü kilitlemek ve SARS-CoV-2 spike proteininin hedefe ulaşarak onu enfekte etmesini ve çoğaltmasını engellemek için tasarlandı.
Dr. Penninger, “Bizde lektinlerle aynı prensibi kullanarak çalışıyoruz. Fakat lektinler, spike proteini üzerindeki nöraljik bölgeleri işgal edebilir ve böylece patojenin hücreye bağlanmasını engelleyebilir. Kapı kapalıdır çünkü anahtar lektinler tarafından tutulmaktadır.” diyor.
Spike Protein olarak bilinen S-proteini SARS-CoV-2’nin kullandığı şaşırtıcı bir çeviklikle hücredeki hedefi yakalayan ve enfekte eden proteindir. S-proteini kan dolaşımındaki hücrelere ve önemli organlara bağlanırken konağın bağışıklık sisteminden kendini saklamak için glikanda gizlenir
Makalenin ilk yazarlarından biri olan Dr. Stefan Mereiter, “Şu anda virüsün koruyucu tabakasına bağlanabilen böylece virüsün hücrelere girişini engelleyen araçlara sahibiz. Dahası, bu glikan bölgeleri dolaşımdaki tüm SARS-CoV-2 varyantlarında korunmuştur, böylece bu onun bir zayıflığı olabilir.” diyor.
Çalışmanın işbirlikçilerinden Linz Üniversitesi Biyofizik Enstitüsünden Dr.Peter Hinterdorfer ve iş arkadaşları, lektinler ve S-proteinleri arasında kaç bağ oluştuğunu ve bağ kuvvetlerini ölçtüler.
Dr. Hinterdorfer, “Ayrıca bu bağları kaydettik.” diye ekledi. Araştırmacılar tarafından, Viyana Doğal Kaynaklar ve Yaşam Bilimleri Üniversitesinde izole edilen spike proteinleri bir solüsyonun yüzeyine aktarıldı ve süreç kaydedildi. Ek olarak Dr. Hinterdorfer, “Spike proteinlerinin dinamiklerinin video ile görülebilmesi muhteşemdi.” diyor.
Üç yüzlü S-proteini mikroskop görüntülerinde her zaman nispeten kapalı göründüğünden dolayı bu metotla yakalanan hareketlilik araştırmacıları şaşırttı.
Dr. Hinterdorfer, “Aslında biz, proteinin yüzeylerde açıldığını ve üç kolunda dinamik olduğunu gördük. Diğer bir deyişle, lektinler biyolojik skalada oldukça uzun zaman kendilerini yapıya bağlayabildiler.” dedi.
Yaklaşık bir saniyelik bağlanma süresi moleküler düzeyde oldukça iyi bir faaliyettir.
Kaynak: https://phys.org/news/2021-05-potential-achilles-heel-sars-cov-virus.html
Görsel Kaynak: https://phys.org/news/2021-05-potential-achilles-heel-sars-cov-virus.html
Editör: Züleyha DEMİRCİ
