Nurgül Kılıç
Giriş
James Cook Üniversitesi’nde araştırma yapan bilim insanları, Avustralya’da oldukça popüler olan Avustralya kaplan karidesinin genomunun haritalandığı, gelecekte daha büyük boyutta çiftlik hayvanları üretebilecekleri ve hastalıklara karşı daha dirençli olmalarına yardımcı olacağını düşündükleri bu çalışmanın önemli bir parçası olmuşlardır.
JCU Su Ürünleri Profesörü Dean Jerry, araştırmanın JCU, Avustralya Genom Araştırma Tesisi (AGRF), Sidney Üniversitesi, CSIRO ve Seafarms Group ile işbirliği olan ARC Gelişmiş Islah için Endüstriyel Dönüşüm Araştırma Merkezi tarafından ortaya çıktığını söyledi. Bu işbirliğinin amacının, genetik seçilim ile Avustralya kara kaplanı karidesinin üretim ve verimliliğini artırmak olduğunu belirtti.
Bu işbirliğini başlatan fikir Avustralya’daki karides çiftliklerinde seçici yetiştirme yöntemleri uygulamak ve bu yöntemlerin uygulanma alanlarını geliştirerek daha büyük ve sağlıklı karidesler üretmekti. Profesör Jerry, karideslerin yapısını ve davranışını belirleyen planı yani genomunu bilmenin bu çalışmalar için önemli olduğunu ve çiftlik hayvanları ve mahsul türlerinde meydana gelen pozitif değişimler ile benzer şekilde, karideslerin de seçici üremelerinde önemli olabileceğini söyledi.
Profesör Jerry, “Karides küçücük bir hayvandır, ancak genomu neredeyse bir insan kadar büyüktür ve yapısal olarak çok daha karmaşıktır.” dedi.
AGRF Biyoinformatik Müdürü Dr. Kenneth Chan, siyah kaplan karidesinin genomunun genetik haritalama sürecinin oldukça zor olduğunu belirtti. Dr. Chan “Sınırları olmayan, uzun süre tekrarlanan üst üste binen bölümleri, milyonlarca eksik, alakasız ve aynı yere sığabilecek çift taraflı 1.9 milyar parçası olan; kutuda takip edilecek bir resmi bile olmayan bir bulmacayı bir araya getirmek kadar zor” olarak tanımlamıştır.
Bilim insanları bu karides türünün viral enfeksiyonlarla savaşma biçiminde daha önce görülmeyen bir şey gözlemlediler. CSIRO Araştırma Bilimcisi Dr. Nick Wade, genomdaki viral enfeksiyonlarla savaşan viral elementlerin “Endojen Viral Element” veya kısaca “EVE” olarak da adlandırılan elementlerin, Avustralya kaplan karideslerinde benzersiz olduğunu ve daha önce hiçbir hayvanda buna benzeyen hiçbir EVE’ye rastlanmadığını söyledi. Dr. Wade, EVE’nin keşfinin, karideslerin virüs enfeksiyonlarıyla nasıl başa çıktıklarını açıkladığını ve böylece karidesleri viral hastalıklara karşı daha dirençli hale getirmek için uygulanabilecek yeni tedaviler elde etmek için daha fazla araştırmanın yapılabilmesi için bir yol olabileceğini belirtti.
Profesör Jerry, ‘’Genomu haritalamanın faydaları, bir dizi tamamlayıcı alanda geliyor. Karides araştırmaları için manzarayı kökten değiştiriyor ve gelişmiş seçim sonuçları için belirli genlerin nasıl hedeflendiği de dahil olmak üzere bir dizi başka fonksiyonel biyolojik araştırmayı mümkün kılıyor.” dedi.
Kaynak: https://phys.org/news/2022-03-world-first-aussie-tiger-prawn-genome.html
Görsel Kaynak: https://acuariofiliamadrid.org/archive/index.php/thread-2493.html
Editör: Yasemin CANKAT